Трудности заключаются в том, что не

Трудности заключаются в том, что не хватает измерений в контрольных точках.

Результаты (английский) 1:

The difficulty is that not enough measurements in control points.

Результаты (английский) 2:

The difficulty lies in the fact that not enough measurements at the control points.

Результаты (английский) 3:

Difficulties are that not enough measurements at the test points.